Adobe AfterEffects CS3新增了很多全新的动态影像和动画的设计制作工具，执行性能更强，此外，AfterEffects CS3还能更加紧密地同Photoshop 和Flash Professional这两款软件结合。这次AfterEffects CS3并没有发布标准版，目前市面上可供用户使用的标准版只有AE 7.0，对此Adobe的解释是“用户更迫切需要使用的是专业版而非标准版”。
Adobe称最新的AE其性能有了超大幅度的提高，尤其能体现在多处理器和多核电脑上，现在可以同时对多帧进行渲染。公司还称对HDV 和 MPEG视频的使用也有了显著的提升，其色彩管理性能并没有改变。
AfterEffects CS3新增的形状图层是为了推进AE的矢量图、动画制作工具。这些工具基于Illustrator矢量工具的原理，它们可以帮助你快速搭建预设形状（preset shape），如矩形、圆角矩形、椭圆形、多边形和五角星形，或者你也可以使用钢笔工具自行绘制。
你可以对所有的元件进行动画设置：strokes（笔触）、 fills（填充物）、gradients（梯度）。此外，软件还有一些特殊的功能，例如Miter Limit (转角限量)、Line Join 、Line Cap。
AfterEffects CS3中还添加了图形动画预设选项，你可以为元件添加一些效果：Twist（扭曲）、Zig Zag（锯齿）、 Pucker（凹陷）、Bloat（膨胀）、trim paths （裁切路径）。
人偶工具是AfterEffects CS3新版本的一个新增特性，你可以移动图层上的元件。这种方法可用来移动角色的胳膊和腿部，也可用于在图形和文本上制作文体效果。
AfterEffects CS3同文本的交互有了很大的改进，因为新版本可以在3D空间中对单一角色进行定位和动画制作，同时还能够用往常的方式编辑文本。
AfterEffects CS3还包括全新的Brainstorm tool，它可以根据你所选择的参数在你的动画上进行创新。它会提供九幅全动态变更预览影像供你选择，你也可以取消某些影像，根据你保留的影像进一步进行变化。
AfterEffects CS3对色彩管理系统进行了一定的调整，提供对颜色工作区（colour workspaces）的支持，这样便可仿效输出标准（output standards）和底片材料（film stocks）。
AfterEffects CS3还新增加了一个Premiere Pro的Clip Notes系统，它可以自动向客户发送项目进度并自动接收客户意见反馈。
AfterEffects CS3支持Photoshop图层样式（Layer Styles），也可支持Photoshop CS3 Extended的视频样式（Video Layers）以及使用Photoshop Vanishing Point工具制作的3D场景数据。
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