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NEC发布基于AI的新型冠状病毒疫苗设计基因分析结果

2020-05-06 14:53 · 稿源:站长之家用户投稿

  NEC日前发布了采用AI预测技术的基因分析结果,用于设计可促进全球多数人群T细胞反应(注1)的SARS-CoV-2(新型冠状病毒)疫苗。本成果旨在帮助防止新型冠状病毒感染症“COVID-19”感染扩大,并支援全球疫苗开发,由NEC OncoImmunity AS(注2)与NEC欧洲研究所合作成立的研究团队所取得。本研究应用了NEC与NEC OncoImmunity在个体化癌症疫苗开发中使用的AI预测技术。

  论文网站“bioRxiv”上发表的研究结果显示,分析数千种SARS-CoV- 2 的基因组序列,锁定了全球人群中最经常被找到的 100 个HLA等位基因(多种免疫型)的表位(可作为疫苗靶点)。

  具体来说,不仅使用预测算法分析了作为冠状病毒名称起源的表面刺突蛋白,还分析了SARS-CoV- 2 的全部蛋白,根据所得数据,对多个HLA等位基因型锁定“热点(Hot Spot)”,该“热点”重复包含了SARS-CoV- 2 蛋白中的共通表位。另外,充分采用本算法,优先选定了全球人群覆盖最广、且病毒蛋白中变异较少、今后也很难发生变异的保存区域中获得的最佳热点组。并且,为确保安全性,除去了病毒表位中与人类蛋白相似度高、特别是在重要脏器中发现的热点。

  本成果的分析结果展示了对世界多数人群安全有效、且亦能应对现在和将来的病毒多样性的疫苗设计,同时也体现了NEC集团AI预测技术的技术水平高度。

  在公开本次研究成果、支援科学进步的同时,NEC将开启以加快疫苗开发为目的的合作活动。

  NEC常务执行董事兼首席技术官西原基夫表示:“很高兴NEC的AI技术能够为当今世界面临的严重问题做出贡献。在世界各国都在为解决这一艰难课题而努力的情况下,NEC作为企业公民也有责任和义务参与到这一行动中。我们将以此次研究为开端,最大限度地活用AI技术这一NEC集团的优势,与各种各样的企业和机构合作,抑制新型冠状病毒感染症的扩大,为了让全球的人们能够尽早恢复日常生活而努力。”

  NEC OncoImmunity的首席科学家Trevor Clancy博士表示:“敝公司首席执行官Richard Stratford博士和其团队以及NEC集团,对于我们针对个体化癌症免疫疗法的机器学习软件‘NEC Immune Profiler’从现在投入的癌症领域迅速适应感染症领域,并能够为新型冠状病毒感染症的应对提供支持,感到非常振奋。我们的AI和生物信息平台,不仅可以守护全球人类,而且对于现在和将来可能发生的新型冠状病毒的多种变异版本,还能够设计出可引发以长期记忆免疫反应等广泛免疫反应的疫苗,这是一种很大的鼓励。”

  NEC欧州研究所数据科学与系统平台部门总经理Saverio Niccolini博士表示:“我们原本是为预测各个癌症患者的免疫反应而设计的算法,应用到了大规模的感染症群体。我们算法中的计算机验证(in silico验证)考虑到了人类在整个大陆的遗传背景。目前,全球正受到日益扩大的新型冠状病毒感染症的威胁,我们的成果显示了为阻止这一威胁的全球举措做出贡献的可能性,这是非常重要的。我们已开始与合作伙伴就wet-lab实验进行协商,正在为开发出对全球多数人群有效的疫苗而迈出重要的一步。”

论文信息

标题:

Artificial intelligence predicts the immunogenic landscape of SARS-CoV-2: toward universal blueprints for vaccine designs

作者:

Brandon Malone, Boris Simovski, Clément Moliné, Jun Cheng, Marius Gheorghe, Hugues Fontenelle, Ioannis Vardaxis, Simen Tenn?e, Jenny-Ann Malmberg, Richard Stratford, Trevor Clancy

(注1)T细胞反应:T细胞是白血球中的一种免疫细胞,激活T细胞的反应为T细胞反应。

(注2)总部:挪威奥斯陆、CEO:Richard Stratford。

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